Budynek powstał obok Wyższego Seminarium Duchownego im. bł. ks. Stefana Wincentego Frelichowskiego. Inwestycję wartą łacznie 17,8 mln zł sfinansowali wspólnie: diecezja, miasto (2,78 mln zł w latach 2011-2012) i samorząd województwa, który przekazał na nią 12,2 mln zł unijnych funduszy z Regionalnego Programu Operacyjnego Województwa Kujawsko-Pomorskiego.
Koncepcję architektoniczną Centrum stworzył - nieodpłatnie - inż. Andrzej Ryczek, natomiast kompleksowy projekt techniczny wykonał arch. Aleksander Furmanek wraz z zespołem projektowym. Kamień węgielny pod centrum został specjalnie przywieziony do Torunia z bazyliki św. Piotra w Rzymie. Inwestycję zrealizowała bydgoska firma EBUD. W trzykondygnacyjnym gmachu o powierzchni 5 tys. m. kwadratowych znajdują się sale konferencyjne, aula, biblioteka, garaż podziemny, magazyny książek i czasopism oraz zaplecze techniczne z węzłem cieplnym. Na trzecim piętrze mieści się część mieszkalna dla prelegentów, duża sala wielofunkcyjna i małe salki konferencyjne. Biblioteka, zaplanowana na 180 tys. woluminów, ma charakter ogólnodostępny - mogą z niej korzystać wszyscy zainteresowani, szczególnie studenci teologii, filozofii, nauk pedagogicznych i społecznych oraz klerycy seminarium.
- Toruń był i nadal chce być miastem dialogu i temu ma służyć Centrum – mówił podczas uroczystości otwarcia Biskup Toruński ks. Andrzej Suski.
Nim została przecięta wstęga, a placówka uroczyście poświęcona, uczestnicy otwarcia wysłuchali wykładu inauguracyjnego na temat problemów pojednania miedzy Polakami i Rosjanami oraz relacji między prawosławiem a katolicyzmem. Wykład był dialogiem przedstawicieli tych dwóch wyznań: prawosławnego arcybiskupa wrocławskiego i szczecińskiego Jeremiasza i katolickiego arcybiskupa i metropolity białostockiego Edwarda Ozorowskiego.
Obecny na uroczystości prezydent Torunia Michał Zaleski podarował placówce współczesny reprint cennego, XVI-wiecznego modlitewnika ks. Doroty, pierwszej żony księcia Albrechta Hohenzollerna - ostatniego mistrza zakonu krzyżackiego. Przewodniczący Rady Miasta Torunia Marian Frąckiewicz przekazał gospodarzom pamiątkową grafikę z Toruniem.
Z Centrum będą korzystać studenci Wydziału Teologicznego i Wyższego Seminarium Duchownego. Będą się tam również odbywać coroczne spotkania z cyklu Colloquia Torunensia, organizowane od 1995 roku przez kurię, miasto, UMK i Towarzystwo Naukowe w Toruniu. Przyjeżdżają na nie do Torunia wybitni goście z całego świata: dostojnicy kościelni, profesorowie teologii, filozofii i nauk społecznych. Do tej pory miało miejsce 16 takich spotkań – odbywały się na Zamku Bierzgłowskim i w Dworze Artusa.
